Proteomics - Downloads
Folgende Tools zur Protein-Massenspektrometrie (Projekt
protein-ms
bei Sourceforge) biete ich an:
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mres2x
Ein Tool, das Mascot™-Ergebnisse in ein tabellarisches Format überführt.
Hier der Link zur entsprechenden
Publikation
und der Link zu mres2x.
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wiff2dta
Ein Tool, das MS- und MSn-Daten der Geräte von Applied Biosystems in DTA, PMF, MGF oder mzXML überführt.
Hier der Link zur entsprechenden
Publikation
und der Link zu wiff2dta.
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theospec
Ein Tool zur Erzeugung küstlicher MS/MS-Spektrendaten zu einer gegebenen Peptidsequenz.
Hier der Link zur entsprechenden
Publikation
und der Link zu theospec.
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Quant
Statistische Methoden zur präzisen, exakten Auswertung von iTRAQ™ Quantifizierungsdaten auf Protein-Ebene.
Erhältlich sind die MathLab-Skripten sowie eine Implementierung für Windows (Quant for Windows),
sowie
eine portable Java-Implementierung namens jTraqX,
die beide für die Verarbeitung von Massendaten ausgelegt sind.